La Facultad de Ciencias Económicas con 61 años de fundación, es la más antigua Facultad de su tipo en toda la nación. Actualmente ofrece 6 carreras de Pre-grado: Economía, Administración de Empresas, Contaduría Pública y Finanzas, Economía Agrícola, Banca y Finanzas y Mercadotecnia, imparte diversos postgrados, maestrías y cursos especiales. Funciona desde los años 80 en el Recinto Universitario Carlos Fonseca Amador (RUCFA) y es dirigido por autoridades electas por periodo de 4 años, siendo éstos: el Decanto, que es «La Máxima autoridad académica y ejecutiva”, el Vice Decanato y el Secretario Facultativo.
